初步研議構想如下（需俟本部相關子（辦）法頒布後方可確定 ）：

1. 繳交登記回饋金立意：要求未登記工廠對於過去違規經營利得，或造成外部負擔，以及取得暫時合法經營付出相對代價，以符公平正義原則，降低合法業者對政府施政衡平性之質疑。
2. 登記回饋金收取方式：
   1. 目前規劃以該工廠營收利得計列，並以未登記工廠於93-97年度（共5年度），依稅捐機關核定之營利事業所得應納稅額5年剔除最高及最低數值後平均值計繳。
   2. 參照工廠管理輔導法罰則第30條規定精神，明定登記回饋金最低收繳額度10萬元；最高收繳額度不設限。
   3. 登記回饋金由直轄市或縣 (市) 政府專款專用。