一般而言，所得稅稽徵作業，從所得的發生，到所得稅額的核定，係依四個步驟進行：包括所得扣繳、暫繳申報、結算申報、調查核定。

「所得扣繳」又包括營利事業所得稅及個人綜合所得稅扣繳兩部分，本篇的主題，雖然是個人綜合所得稅方面，但是大部分的扣繳所得類別，仍然可以適用到所得人為營利事業單位，甚至於非營利事業單位，如執行業務者、教育、文化、公益、慈善等機關、團體。牽涉的對象，從所得的給付者（付錢的人），到所得的收益者（賺錢的人），幾乎可說是無所不包。

就會計從業人員而言，每天接觸的就是金錢的收與支，這些收支該如何正確而簡便的辦理扣繳，或應否被扣繳，已經變成一種必備的稅務知識，如能快速而有效的獲取這些知識，便能正確的辦理扣繳業務，那麼就不需要增加稅務人員去扣繳檢查，也就可以降低稽徵成本，減少政府預算支出。

本篇區分為五大部分：

第一 所得稅扣繳制度的介紹，
第二 各類所得逐項說明，
第三 如何辦理所得稅扣繳及申報事宜，
第四 違章處罰之規定，
第五 外商營利事業所得稅之扣繳及稽徵實務。

扣繳義務人聘請外籍員工時，應注意相關扣繳規定

自98年1月1日起，扣繳義務人給付非中華民國境內居住之個人之薪資所得，得視全月給付總額按20%或6%之扣繳率扣取稅款，並於代扣稅款之日起10日內，將所扣稅款向國庫繳清，另須開具扣繳憑單，向所轄稽徵機關申報核驗。

各類所得扣繳率標準第3條第1項第2款業於98年1月16日修正發布，納稅義務人如為非中華民國境內居住之個人，且非屬政府派駐國外之工作人員，自98年1月1日起，個人全月薪資給付總額在行政院核定每月基本工資1.5倍以下者，按給付額扣取6%之稅款；如超過者，則按給付額扣取20%之稅款。

舉例說明：

一、泰國籍A君經仲介來臺擔任建築工，依聘僱契約及居留證所定在臺居留期間為95年4月1日至98年3月31日，則A君95、96、97年度均屬我國「居住者」，98年度核准在臺居留僅90天，屬「非居住者」，又其每月工資為17,280元，在行政院核定基本工資17,280元之1.5倍(17,280元 ×1.5＝25,920元)以下，自98年1月起，每月應按6%扣繳率扣繳，並於代扣稅款之日起10日內將所扣稅款向國庫繳清，同時向所轄稽徵機關申報扣繳憑單。

二、美國籍B君經派赴臺灣擔任美商在臺分公司經理，居留臺灣期間為95年4月1日至98年3月31日，則B君95、96、97年度均屬「居住者」，98年度核准在臺居留僅90天，屬「非居住者」，又其每月薪資150,000元，自98年1月起，每月應按20%扣繳率扣繳，並於代扣稅款之日起10日內將所扣稅款向國庫繳清，同時向所轄稽徵機關申報扣繳憑單。

三、英國籍C君於核准在臺灣補習班擔任英語教師，核准工作期間自98年1月 1日至99年12月31日，每月薪資60,000元。扣繳單位自98年2月份起就其全月薪資按「居住者」身分，依薪資所得扣繳辦法規定扣繳，惟C君因個人因素提早於98年3月31日解約，是以應補繳原扣繳率與其「非居住者」稅率20%之差額。